El Jardín Botánico mantiene un banco de semillas congeladas que forma parte de la Red de Bancos de Germoplasma de los diferentes jardines botánicos. El nuestro está dirigido por el biólogo D. Angel López López.

Todo el material está debidamente tratado para la conservación a largo plazo y como garantía de disponibilidad para estudios científicos, multiplicación de especies o como reserva en caso de catástrofes ecológicas. Las especies en peligro de extinción encuentran en estos bancos una posibilidad de reproducción para conseguir repoblaciones.